当两个数据帧具有不同的列集时,按行组合(rbind)

有可能行绑定两个没有相同列集的数据帧吗?我希望保留绑定后不匹配的列。

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你可以使用gtools包中的smartbind

例子:

library(gtools)
df1 <- data.frame(a = c(1:5), b = c(6:10))
df2 <- data.frame(a = c(11:15), b = c(16:20), c = LETTERS[1:5])
smartbind(df1, df2)
# result
a  b    c
1.1  1  6 <NA>
1.2  2  7 <NA>
1.3  3  8 <NA>
1.4  4  9 <NA>
1.5  5 10 <NA>
2.1 11 16    A
2.2 12 17    B
2.3 13 18    C
2.4 14 19    D
2.5 15 20    E

您也可以只取出公共列名。

> cols <- intersect(colnames(df1), colnames(df2))
> rbind(df1[,cols], df2[,cols])

plyr中的rbind.fill可能就是你要找的。

如果df1中的列是df2中的列的子集(通过列名):

df3 <- rbind(df1, df2[, names(df1)])

也许我完全误解了你的问题,但“我希望保留绑定后不匹配的列”使我认为你正在寻找一个类似于SQL查询的left joinright join。R具有merge函数,它允许您指定左连接、右连接或内部连接,类似于SQL中的连接表。

这里已经有一个关于这个主题的很好的问题和答案:如何加入(合并)数据帧(内部,外部,左,右)?

我写了一个函数来做这件事,因为我喜欢我的代码告诉我什么是错误的。这个函数将显式地告诉您哪些列名不匹配,以及是否存在类型不匹配。然后它会尽最大努力组合data.frames。限制是一次只能合并两个data.frame。

### combines data frames (like rbind) but by matching column names
# columns without matches in the other data frame are still combined
# but with NA in the rows corresponding to the data frame without
# the variable
# A warning is issued if there is a type mismatch between columns of
# the same name and an attempt is made to combine the columns
combineByName <- function(A,B) {
a.names <- names(A)
b.names <- names(B)
all.names <- union(a.names,b.names)
print(paste("Number of columns:",length(all.names)))
a.type <- NULL
for (i in 1:ncol(A)) {
a.type[i] <- typeof(A[,i])
}
b.type <- NULL
for (i in 1:ncol(B)) {
b.type[i] <- typeof(B[,i])
}
a_b.names <- names(A)[!names(A)%in%names(B)]
b_a.names <- names(B)[!names(B)%in%names(A)]
if (length(a_b.names)>0 | length(b_a.names)>0){
print("Columns in data frame A but not in data frame B:")
print(a_b.names)
print("Columns in data frame B but not in data frame A:")
print(b_a.names)
} else if(a.names==b.names & a.type==b.type){
C <- rbind(A,B)
return(C)
}
C <- list()
for(i in 1:length(all.names)) {
l.a <- all.names[i]%in%a.names
pos.a <- match(all.names[i],a.names)
typ.a <- a.type[pos.a]
l.b <- all.names[i]%in%b.names
pos.b <- match(all.names[i],b.names)
typ.b <- b.type[pos.b]
if(l.a & l.b) {
if(typ.a==typ.b) {
vec <- c(A[,pos.a],B[,pos.b])
} else {
warning(c("Type mismatch in variable named: ",all.names[i],"\n"))
vec <- try(c(A[,pos.a],B[,pos.b]))
}
} else if (l.a) {
vec <- c(A[,pos.a],rep(NA,nrow(B)))
} else {
vec <- c(rep(NA,nrow(A)),B[,pos.b])
}
C[[i]] <- vec
}
names(C) <- all.names
C <- as.data.frame(C)
return(C)
}
rbind.ordered=function(x,y){


diffCol = setdiff(colnames(x),colnames(y))
if (length(diffCol)>0){
cols=colnames(y)
for (i in 1:length(diffCol)) y=cbind(y,NA)
colnames(y)=c(cols,diffCol)
}


diffCol = setdiff(colnames(y),colnames(x))
if (length(diffCol)>0){
cols=colnames(x)
for (i in 1:length(diffCol)) x=cbind(x,NA)
colnames(x)=c(cols,diffCol)
}
return(rbind(x, y[, colnames(x)]))
}

gtools/smartbind不喜欢使用Dates,可能是因为它是as.vector。这是我的解决方案……

sbind = function(x, y, fill=NA) {
sbind.fill = function(d, cols){
for(c in cols)
d[[c]] = fill
d
}


x = sbind.fill(x, setdiff(names(y),names(x)))
y = sbind.fill(y, setdiff(names(x),names(y)))


rbind(x, y)
}

最近的解决方案是使用dplyrbind_rows函数,我认为它比smartbind更有效。

df1 <- data.frame(a = c(1:5), b = c(6:10))
df2 <- data.frame(a = c(11:15), b = c(16:20), c = LETTERS[1:5])
dplyr::bind_rows(df1, df2)
a  b    c
1   1  6 <NA>
2   2  7 <NA>
3   3  8 <NA>
4   4  9 <NA>
5   5 10 <NA>
6  11 16    A
7  12 17    B
8  13 18    C
9  14 19    D
10 15 20    E

data.table的替代方法:

library(data.table)
df1 = data.frame(a = c(1:5), b = c(6:10))
df2 = data.frame(a = c(11:15), b = c(16:20), c = LETTERS[1:5])
rbindlist(list(df1, df2), fill = TRUE)

只要对象被转换为data.table对象,rbind也将在data.table中工作

rbind(setDT(df1), setDT(df2), fill=TRUE)

也适用于这种情况。当您有几个数据时,这可能更可取。表,而不想构造列表。

只是为了文档。你可以用下面的形式尝试Stack库及其函数Stack:

Stack(df_1, df_2)

我也有一个印象,对于大数据集,它比其他方法更快。

大多数基本R答案解决的情况是,只有一个data.frame有额外的列,或者结果data.frame有这些列的交集。因为OP写的是我希望保留绑定后不匹配的列,所以使用base R方法来解决这个问题的答案可能值得发布。

下面,我将介绍两个基本R方法:一个改变原始data.frames,另一个不改变。此外,我还提供了一种将非破坏性方法推广到两个以上的数据帧的方法。

首先,让我们获取一些示例数据。

# sample data, variable c is in df1, variable d is in df2
df1 = data.frame(a=1:5, b=6:10, d=month.name[1:5])
df2 = data.frame(a=6:10, b=16:20, c = letters[8:12])

< p > 两个数据帧,改变原始数据 < br > 为了在rbind中保留这两个data.frames中的所有列(并允许该函数正常工作而不会导致错误),您需要在每个data.frame中添加NA列,并使用setdiff填充适当的缺失名称
# fill in non-overlapping columns with NAs
df1[setdiff(names(df2), names(df1))] <- NA
df2[setdiff(names(df1), names(df2))] <- NA

现在,rbind-em

rbind(df1, df2)
a  b        d    c
1   1  6  January <NA>
2   2  7 February <NA>
3   3  8    March <NA>
4   4  9    April <NA>
5   5 10      May <NA>
6   6 16     <NA>    h
7   7 17     <NA>    i
8   8 18     <NA>    j
9   9 19     <NA>    k
10 10 20     <NA>    l

注意,前两行更改了原始data.frames, df1和df2,将完整的列添加到这两行。


< p > 两帧数据,不要改变原始数据 < br > 为了保持原始data.frames的完整性,首先遍历不同的名称,返回na的命名向量,这些na使用c与data.frame连接到一个列表中。然后,data.frame将结果转换为rbind.

.frame的适当data.frame
rbind(
data.frame(c(df1, sapply(setdiff(names(df2), names(df1)), function(x) NA))),
data.frame(c(df2, sapply(setdiff(names(df1), names(df2)), function(x) NA)))
)

< p > 许多数据帧不会改变原始数据 < br > 在你有超过两个data.frames的情况下,你可以这样做
# put data.frames into list (dfs named df1, df2, df3, etc)
mydflist <- mget(ls(pattern="df\\d+"))
# get all variable names
allNms <- unique(unlist(lapply(mydflist, names)))


# put em all together
do.call(rbind,
lapply(mydflist,
function(x) data.frame(c(x, sapply(setdiff(allNms, names(x)),
function(y) NA)))))

也许看不到原始data。frames的行名会更好一些?然后这样做。

do.call(rbind,
c(lapply(mydflist,
function(x) data.frame(c(x, sapply(setdiff(allNms, names(x)),
function(y) NA)))),
make.row.names=FALSE))

你也可以使用sjmisc::add_rows(),它使用dplyr::bind_rows(),但与bind_rows()不同,add_rows()保留属性,因此对标签数据有用。

请参阅以下带有标记数据集的示例。函数__abc0打印带有值标签的频率表,如果表示数据被标记。

library(sjmisc)
library(dplyr)


data(efc)
# select two subsets, with some identical and else different columns
x1 <- efc %>% select(1:5) %>% slice(1:10)
x2 <- efc %>% select(3:7) %>% slice(11:20)


str(x1)
#> 'data.frame':    10 obs. of  5 variables:
#>  $ c12hour : num  16 148 70 168 168 16 161 110 28 40
#>   ..- attr(*, "label")= chr "average number of hours of care per week"
#>  $ e15relat: num  2 2 1 1 2 2 1 4 2 2
#>   ..- attr(*, "label")= chr "relationship to elder"
#>   ..- attr(*, "labels")= Named num  1 2 3 4 5 6 7 8
#>   .. ..- attr(*, "names")= chr  "spouse/partner" "child" "sibling" "daughter or son -in-law" ...
#>  $ e16sex  : num  2 2 2 2 2 2 1 2 2 2
#>   ..- attr(*, "label")= chr "elder's gender"
#>   ..- attr(*, "labels")= Named num  1 2
#>   .. ..- attr(*, "names")= chr  "male" "female"
#>  $ e17age  : num  83 88 82 67 84 85 74 87 79 83
#>   ..- attr(*, "label")= chr "elder' age"
#>  $ e42dep  : num  3 3 3 4 4 4 4 4 4 4
#>   ..- attr(*, "label")= chr "elder's dependency"
#>   ..- attr(*, "labels")= Named num  1 2 3 4
#>   .. ..- attr(*, "names")= chr  "independent" "slightly dependent" "moderately dependent" "severely dependent"


bind_rows(x1, x1) %>% frq(e42dep)
#>
#> # e42dep <numeric>
#> # total N=20  valid N=20  mean=3.70  sd=0.47
#>
#>   val frq raw.prc valid.prc cum.prc
#>     3   6      30        30      30
#>     4  14      70        70     100
#>  <NA>   0       0        NA      NA


add_rows(x1, x1) %>% frq(e42dep)
#>
#> # elder's dependency (e42dep) <numeric>
#> # total N=20  valid N=20  mean=3.70  sd=0.47
#>
#>  val                label frq raw.prc valid.prc cum.prc
#>    1          independent   0       0         0       0
#>    2   slightly dependent   0       0         0       0
#>    3 moderately dependent   6      30        30      30
#>    4   severely dependent  14      70        70     100
#>   NA                   NA   0       0        NA      NA

您可以将它们插入到原始数据库(db1)的末尾,并添加第二个数据库的行数。db2中不包括的列将显示NA值。

db1[nrow(db1)+1:nrow(db1)+nrow(db2), names(db2)] <- db2