从命令行运行R脚本

我有一个名为a.r的文件，它的chmod是755，

sayHello <- function(){
print('hello')
}


sayHello()

我如何通过命令行运行这个?

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您需要使用?Rscript命令从终端运行R脚本。

看看http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/utils/html/Rscript.html

例子

## example #! script for a Unix-alike


#! /path/to/Rscript --vanilla --default-packages=utils
args <- commandArgs(TRUE)
res <- try(install.packages(args))
if(inherits(res, "try-error")) q(status=1) else q()
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最佳答案

如果你想要输出输出到终端，最好使用Rscript

Rscript a.R

注意，当使用R CMD BATCH a.R时，将创建一个名为a.Rout的新文件，而不是将输出重定向到标准输出并在终端上显示。

R CMD BATCH a.R
# Check the output
cat a.Rout

关于使用Rscript需要注意的另一件事是，默认情况下它不会加载methods包，这可能会引起混淆。如果你依赖于方法提供的任何东西你会想要在你的脚本中显式地加载它。

如果你真的想使用./a.R方式调用脚本，你可以在脚本顶部添加一个合适的#!

#!/usr/bin/env Rscript
sayHello <- function(){
print('hello')
}


sayHello()

我还会注意到，如果你在*unix系统上运行，有一个有用的的小包，它提供了简单的命令行管道到r。可能有必要使用littleler通过脚本运行闪亮的应用程序?更多细节请参见在这个问题中。

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从命令行运行R脚本的另一种方法是:

R < scriptName.R --no-save

或者使用--save。

参见在命令行(终端)上使用R脚本的最佳方式是什么?。

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这并没有直接回答这个问题。但有些人可能会在这里结束，因为他们想从终端运行R的联机程序。例如，如果你只是想安装一些丢失的包并退出，这个联机程序可以非常方便。当我突然发现我错过了一些包，并且我想将它们安装到我想要的地方时，我经常使用它。

  • 安装到默认位置:

    R -e 'install.packages(c("package1", "package2"))'

  • To install to a location that requires root privileges:

    R -e 'install.packages(c("package1", "package2"), lib="/usr/local/lib/R/site-library")'
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如何运行Rmd命令与针织和rmarkdown的多个命令，然后上传一个HTML文件到rpub

下面是一个示例:加载两个库并运行R命令

R -e 'library("rmarkdown");library("knitr");rmarkdown::render("NormalDevconJuly.Rmd")'


R -e 'library("markdown");rpubsUpload("normalDev","NormalDevconJuly.html")'
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在*Unix系统中使用Rscript的另一种方法是进程替换。

Rscript <(zcat a.r)
# [1] "hello"

这显然与接受的答案是一样的，但这允许你操纵和运行你的文件，而不节省它的命令行功能，例如:

Rscript <(sed s/hello/bye/ a.r)
# [1] "bye"

类似于Rscript -e "Rcode"，它也允许在不保存到文件的情况下运行。因此，它可以与生成r代码的脚本一起使用，例如:

Rscript <(echo "head(iris,2)")
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
# 1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
# 2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
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将代码保存在ABC中。R，文件看起来是这样的:

sayHello <- function(){
print('hello')
}


sayHello()

创建另一个名为run的文件。CMD并在那里放置以下一行:

"C:\Install\R\Rscript.exe" "C:\Users\ABC.R"

双击“运行”。它运行你的R代码。


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