如何读取数据时,一些数字包含逗号作为千分隔符?

我有一个 csv 文件,其中一些数值用字符串表示,逗号作为千分隔符,例如 "1,513"而不是 1513。将数据读入 R 的最简单方法是什么?

我可以使用 read.csv(..., colClasses="character"),但是在将这些列转换为数字之前,我必须从相关元素中去掉逗号,而且我找不到一种简单的方法来做到这一点。

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不确定如何让 read.csv正确地解释它,但是您可以使用 gsub","替换为 "",然后使用 as.numeric将字符串转换为 numeric:

y <- c("1,200","20,000","100","12,111")
as.numeric(gsub(",", "", y))
# [1]  1200 20000 100 12111

这是 前情提要(和在 这里是 Q2)。

或者,您可以对文件进行预处理,例如在 unix 中使用 sed

我认为预处理是可行的方法。你可以使用 记事本 + + ,它有一个正则表达式替换选项。

例如,如果你的文件是这样的:

"1,234","123","1,234"
"234","123","1,234"
123,456,789

然后,可以使用正则表达式 "([0-9]+),([0-9]+)"并将其替换为 \1\2

1234,"123",1234
"234","123",1234
123,456,789

然后可以使用 x <- read.csv(file="x.csv",header=FALSE)读取文件。

我想使用 R 而不是预处理的数据,因为它使它更容易当数据被修改。根据 Shane 关于使用 gsub的建议,我认为这是我能做的最简洁的事情了:

x <- read.csv("file.csv",header=TRUE,colClasses="character")
col2cvt <- 15:41
x[,col2cvt] <- lapply(x[,col2cvt],function(x){as.numeric(gsub(",", "", x))})

R 中的“预处理”:

lines <- "www, rrr, 1,234, ttt \n rrr,zzz, 1,234,567,987, rrr"

可以在 textConnection上使用 readLines,然后只删除位于数字之间的逗号:

gsub("([0-9]+)\\,([0-9])", "\\1\\2", lines)


## [1] "www, rrr, 1234, ttt \n rrr,zzz, 1234567987, rrr"

了解以逗号作为十进制分隔符可以由 read.csv2(自动)或 read.table (设置“ dec”参数)处理是非常有用的,但与这个问题没有直接关系。

编辑: 后来我通过设计一个新的类发现了如何使用 colClass。参见:

如何在 R 中加载带有1000个分隔符的 df 作为数值类?

您可以让 read.table 或 read.csv 半自动地为您执行此转换。首先创建一个新的类定义,然后创建一个转换函数,并使用 setAs 函数将其设置为“ as”方法,如下所示:

setClass("num.with.commas")
setAs("character", "num.with.commas",
function(from) as.numeric(gsub(",", "", from) ) )

然后像下面这样运行 read.csv:

DF <- read.csv('your.file.here',
colClasses=c('num.with.commas','factor','character','numeric','num.with.commas'))

在调用 gsub时,如果数字由“ .”分隔,小数由“ ,”(1.200.000.00)分隔,则必须使用 set fixed=TRUE as.numeric(gsub(".","",y,fixed=TRUE))

使用 mutate_all和管道的 dplyr解决方案

说你有以下资料:

> dft
Source: local data frame [11 x 5]


Bureau.Name Account.Code   X2014   X2015   X2016
1       Senate          110 158,000 211,000 186,000
2       Senate          115       0       0       0
3       Senate          123  15,000  71,000  21,000
4       Senate          126   6,000  14,000   8,000
5       Senate          127 110,000 234,000 134,000
6       Senate          128 120,000 159,000 134,000
7       Senate          129       0       0       0
8       Senate          130 368,000 465,000 441,000
9       Senate          132       0       0       0
10      Senate          140       0       0       0
11      Senate          140       0       0       0

并希望从年份变量 X2014-X2016中删除逗号,以及 把它们转换成数字。还有,我们假设 X2014-X2016被读取为 因素(违约)

dft %>%
mutate_all(funs(as.character(.)), X2014:X2016) %>%
mutate_all(funs(gsub(",", "", .)), X2014:X2016) %>%
mutate_all(funs(as.numeric(.)), X2014:X2016)

mutate_allfuns中的函数应用于指定的列

我是按顺序执行的,一次执行一个函数(如果使用多个 函数,然后创建额外的、不必要的列)

这个问题已经有好几年历史了,但我偶然发现了它,这意味着也许其他人也会这么做。

readr库/包有一些很好的特性。其中之一是一个很好的方式来解释“混乱”栏目,就像这些。

library(readr)
read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5",
col_types = list(col_numeric())
)

这个产量

资料来源: 本地数据框架[4x1]

  numbers
(dbl)
1   800.0
2  1800.0
3  3500.0
4     6.5

读取文件时的一个重要问题是: 您要么必须预处理(如上面关于 sed的注释) ,要么必须处理 在看书的时候。通常情况下,如果你试图在事后解决问题,会有一些很难找到的危险假设。(这就是为什么平面文件从一开始就如此邪恶。)

例如,如果我没有标记 col_types,我会得到这个:

> read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5")
Source: local data frame [4 x 1]


numbers
(chr)
1     800
2   1,800
3    3500
4     6.5

(注意,它现在是 chr(character)而不是 numeric。)

或者,更危险的是,如果它足够长,而且大多数早期元素不包含逗号:

> set.seed(1)
> tmp <- as.character(sample(c(1:10), 100, replace=TRUE))
> tmp <- c(tmp, "1,003")
> tmp <- paste(tmp, collapse="\"\n\"")

(使最后几个元素看起来像:)

\"5\"\n\"9\"\n\"7\"\n\"1,003"

那你就会发现根本读不懂那个逗号!

> tail(read_csv(tmp))
Source: local data frame [6 x 1]


3"
(dbl)
1 8.000
2 5.000
3 5.000
4 9.000
5 7.000
6 1.003
Warning message:
1 problems parsing literal data. See problems(...) for more details.

一个非常方便的方法是 readr::read_delim-family: 将带有多个分隔符的 csv 导入到 R 中,可以这样做:

txt <- 'OBJECTID,District_N,ZONE_CODE,COUNT,AREA,SUM
1,Bagamoyo,1,"136,227","8,514,187,500.000000000000000","352,678.813105723350000"
2,Bariadi,2,"88,350","5,521,875,000.000000000000000","526,307.288878142830000"
3,Chunya,3,"483,059","30,191,187,500.000000000000000","352,444.699742995200000"'


require(readr)
read_csv(txt) # = read_delim(txt, delim = ",")

结果就是预期的结果:

# A tibble: 3 × 6
OBJECTID District_N ZONE_CODE  COUNT        AREA      SUM
<int>      <chr>     <int>  <dbl>       <dbl>    <dbl>
1        1   Bagamoyo         1 136227  8514187500 352678.8
2        2    Bariadi         2  88350  5521875000 526307.3
3        3     Chunya         3 483059 30191187500 352444.7

使用 read _ delim 函数(它是 雷达库的一部分) ,您可以指定其他参数:

locale = locale(decimal_mark = ",")


read_delim("filetoread.csv", ";", locale = locale(decimal_mark = ","))

* 第二行中的分号意味着 read _ delm 将读取以 csv 分号分隔的值。

这将有助于阅读所有逗号数字作为正确的数字。

问候

Mateusz Kania

我们也可以使用 readr::parse_number,但是列必须是字符。如果我们想对多个列应用它,我们可以使用 lapply循环遍历列

df[2:3] <- lapply(df[2:3], readr::parse_number)
df


#  a        b        c
#1 a    12234       12
#2 b      123  1234123
#3 c     1234     1234
#4 d 13456234    15342
#5 e    12312 12334512

或者使用 dplyr中的 mutate_at将其应用于特定的变量。

library(dplyr)
df %>% mutate_at(2:3, readr::parse_number)
#Or
df %>% mutate_at(vars(b:c), readr::parse_number)

资料

df <- data.frame(a = letters[1:5],
b = c("12,234", "123", "1,234", "13,456,234", "123,12"),
c = c("12", "1,234,123","1234", "15,342", "123,345,12"),
stringsAsFactors = FALSE)