比较两个NumPy数组是否相等

比较两个NumPy数组相等性的最简单方法是什么(其中相等性定义为:对于所有索引i: A[i] == B[i], A = B iff)?

简单地使用==给我一个布尔数组:

 >>> numpy.array([1,1,1]) == numpy.array([1,1,1])


array([ True,  True,  True], dtype=bool)

我必须and这个数组的元素来确定数组是否相等,或者有更简单的比较方法吗?

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(A==B).all()

测试数组(A==B)的所有值是否为True。

注意:也许你还想测试A和B的形状,比如A.shape == B.shape

特殊情况和替代方案(来自dbaupp的回答和yoavram的评论)

应当指出的是:

  • 这种解决方案在特定情况下可能会有奇怪的行为:如果AB中有一个为空,而另一个包含单个元素,则返回True。由于某些原因,比较A==B返回一个空数组,为此all操作符返回True
  • 另一个风险是,如果AB没有相同的形状且不可广播,则此方法将引发错误。

总之,如果你对AB形状有疑问,或者只是想要安全:使用一个专门的函数:

np.array_equal(A,B)  # test if same shape, same elements values
np.array_equiv(A,B)  # test if broadcastable shape, same elements values
np.allclose(A,B,...) # test if same shape, elements have close enough values

(A==B).all()解决方案非常简洁,但有一些内置函数用于此任务。即array_equalallclosearray_equiv

(不过,一些使用timeit的快速测试似乎表明(A==B).all()方法是最快的,这有点奇怪,因为它必须分配一个全新的数组。)

让我们使用下面的代码段来衡量性能。

import numpy as np
import time


exec_time0 = []
exec_time1 = []
exec_time2 = []


sizeOfArray = 5000
numOfIterations = 200


for i in xrange(numOfIterations):


A = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))
B = np.random.randint(0,255,(sizeOfArray,sizeOfArray))


a = time.clock()
res = (A==B).all()
b = time.clock()
exec_time0.append( b - a )


a = time.clock()
res = np.array_equal(A,B)
b = time.clock()
exec_time1.append( b - a )


a = time.clock()
res = np.array_equiv(A,B)
b = time.clock()
exec_time2.append( b - a )


print 'Method: (A==B).all(),       ', np.mean(exec_time0)
print 'Method: np.array_equal(A,B),', np.mean(exec_time1)
print 'Method: np.array_equiv(A,B),', np.mean(exec_time2)

输出

Method: (A==B).all(),        0.03031857
Method: np.array_equal(A,B), 0.030025185
Method: np.array_equiv(A,B), 0.030141515

根据上面的结果,numpy方法似乎比= =操作符和所有()方法的组合更快,通过比较numpy方法,最快的方法似乎是numpy.array_equal方法。

如果你想检查两个数组是否有相同的shapeelements,你应该使用np.array_equal,因为它是文档中推荐的方法。

在性能方面,不要指望任何相等检查都能击败另一个,因为优化comparing two elements的空间并不大。为了安全起见,我还是做了一些检查。

import numpy as np
import timeit


A = np.zeros((300, 300, 3))
B = np.zeros((300, 300, 3))
C = np.ones((300, 300, 3))


timeit.timeit(stmt='(A==B).all()', setup='from __main__ import A, B', number=10**5)
timeit.timeit(stmt='np.array_equal(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
timeit.timeit(stmt='np.array_equiv(A, B)', setup='from __main__ import A, B, np', number=10**5)
> 51.5094
> 52.555
> 52.761

所以基本相等,不需要讨论速度。

(A==B).all()的行为类似于下面的代码片段:

x = [1,2,3]
y = [1,2,3]
print all([x[i]==y[i] for i in range(len(x))])
> True

通常两个数组会有一些小的数值错误,

你可以使用numpy.allclose(A,B)而不是(A==B).all()。返回bool值True/False

现在使用np.array_equal。从文档:

np.array_equal([1, 2], [1, 2])
True
np.array_equal(np.array([1, 2]), np.array([1, 2]))
True
np.array_equal([1, 2], [1, 2, 3])
False
np.array_equal([1, 2], [1, 4])
False

在其他答案之上,你现在可以使用断言:

numpy.testing.assert_array_equal(x, y)

你也有类似的函数,如numpy.testing.assert_almost_equal()

https://numpy.org/doc/stable/reference/generated/numpy.testing.assert_array_equal.html

只是为了完整起见。我将添加 比较两个数组的Pandas方法:

import numpy as np
a = np.arange(0.0, 10.2, 0.12)
b = np.arange(0.0, 10.2, 0.12)
ap = pd.DataFrame(a)
bp = pd.DataFrame(b)


ap.equals(bp)
True
供你参考:如果你正在寻找如何 比较向量,数组或R中的数据框架。 你可以使用:

identical(iris1, iris2)
#[1] TRUE
all.equal(array1, array2)
#> [1] TRUE